包 | 维护人员 | 标题 |
---|---|---|
AffyExpress | 李学军 | Affymetrix质量评估和分析工具 |
apComplex | 丹尼斯Scholtens | 使用AP-MS蛋白数据估计蛋白复合体成员 |
arrayQuality | 艾格尼丝Paquet | 点阵阵列质量评估 |
ArrayTools | 亚瑟•李 | geneChip分析包 |
BioMVCClass | 伊丽莎白·惠伦 | 模型-视图-控制器(MVC)类使用Biobase |
cellHTS | Ligia胸罩 | 基于细胞的筛选分析 |
cellHTS2 | Florian Hahne | 基于细胞筛选的分析——修订后的cellHTS |
CGHcall | 会发生Vosse | 调用阵列CGH肿瘤谱的像差。 |
CGHregions | 会发生Vosse | 最小信息丢失的阵列CGH数据降维方法。 |
国王杯 | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 执行癌症异常值分析的功能。 |
ctc | 安东尼·卢卡斯 | 集群和树的转换。 |
EBImage | 格雷戈勒加索尔 | 图像处理工具箱为R |
ecolitk | 劳伦特 | 大肠杆菌的元数据和工具 |
exonmap | Crispin米勒 | Affymetrix外显子阵列数据的高级分析 |
explorase | 迈克尔•劳伦斯 | GUI用于系统生物学数据的探索性数据分析 |
flowClust | 拉斐尔Gottardo | 流式细胞术聚类 |
flowViz | Florian Hahne | 流式细胞术可视化 |
群 | 丹特南鲍姆 | 在R和其他生物信息学程序之间广播数据 |
geneplotter | Biocore Team c/o BioC用户列表 | Bioconductor的图形相关功能 |
GeneRegionScan | Lasse Folkersen | GeneRegionScan |
GenomeGraphs | 史蒂芬Durinck | 绘制来自Ensembl的基因组信息 |
goTools | 艾格尼丝Paquet | 基因本体数据库的功能 |
Heatplus | 亚历山大plone ( | 显示协变量和着色簇的热图 |
帮助 | 里德·f·汤普森 | 帮助数据分析工具 |
hexbin | 尼古拉斯Lewin-Koh | 六边形装箱例程 |
HilbertVis | 西蒙•安德斯 | 希尔伯特曲线可视化 |
HilbertVisGUI | 西蒙•安德斯 | HilbertVisGUI |
染色体组型 | 卡尔·j·戴科马 | 染色体组型 |
KCsmart | Jorma de Ronde | 多样本aCGH分析包使用核卷积 |
macat | Joern Toedling | 微阵列染色体分析工具 |
maCorrPlot | 亚历山大plone ( | 可视化微阵列数据中的人工关联 |
时间的 | 约翰内斯Rainer | 微阵列数据库和微阵列数据分析的实用函数。 |
MergeMaid | 于宁波钟 | 合并女仆 |
Mfuzz | 马提亚Futschik | 时间序列基因表达数据的软聚类 |
MVCClass | 伊丽莎白·惠伦 | 模型-视图-控制器(MVC)类 |
奥林 | 马提亚Futschik | 优化双色微阵列的局部强度依赖归一化 |
OLINgui | 马提亚Futschik | 图形用户界面的OLIN |
普拉达 | Florian Hahne | 基于细胞功能分析的数据分析 |
quantsmooth | 1月东 | 分位数平滑和阵列数据的基因组可视化 |
犹太人的尊称 | 卡尔·j·戴科马 | 地域表达偏见 |
RNAither | 诺拉Rieber | 高通量RNAi筛选的统计分析 |
rtracklayer | 迈克尔•劳伦斯 | R接口的基因组浏览器和他们的注释轨道 |
SIM卡 | 马丁·范·伊特森 | 基因表达和拷贝数数据的综合分析 |
simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的高层次分析Affymetrix数据 |
SNPchip | 罗伯特Scharpf | 高通量SNP芯片数据的类和方法 |
tilingArray | (徐 | 高密度寡核苷酸平铺阵列转录本定位 |
topGO | Adrian Alexa | topGO:基因本体富集分析 |
VanillaICE | 罗伯特Scharpf | 高通量基因分型阵列的隐马尔可夫模型 |
xmapbridge | 蒂姆·耶茨 | 将绘图文件导出到xmapBridge,以便在X:Map中可视化 |