ArrayTools

geneChip分析包

这个包质量评估旨在提供解决方案和差异表达基因检测Affymetrix GeneChips,包括1.0 - 3 '借助于和基因阵列。HTML格式的包生成综合分析报告。报告页面上的超链接会导致一系列的QC情节,处理数据,差异表达基因列表。报告表格格式的差异表达基因注释超链接在线生物数据库。

作者	李Xiwei吴,亚瑟
维护人员	亚瑟•李

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“ArrayTools”)

1。底漆	PDF	R脚本
参考手册

biocViews	微阵列,OneChannel,质量控制,预处理,统计数据,DifferentialExpression,注释,ReportWriting,可视化
取决于	R,affy,Biobase、图形、grDeviceslimma、方法、统计xtable跑龙套
进口
建议	simpleaffyR2HTML,affydata,affyPLM,genefilter,annaffy,gcrma,hugene10sttranscriptcluster.db
系统需求
许可证	LGPL (> = 2.0)
URL
取决于我
进口我
建议我
发展历史	Bioconductor更新日志