Biostrings

表示生物序列的字符串对象，以及匹配算法

内存高效的字符串容器，字符串匹配算法和其他实用程序，用于快速操作大型生物序列或序列集。

作者	H.佩奇，P.阿布永，R.绅士和S.德布罗伊
维护人员	h .页面

要安装这个包，启动R并输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“Biostrings”)

成对序列比对	PDF	R脚本
Biostrings 2中定义的基本类的简短介绍	PDF	R脚本
关于DNAString()构造函数的向量化特性的一些旧注释。不适合最终用户。	PDF	R脚本
利用Biostrings和BSgenome数据包进行高效的基因组搜索	PDF	R脚本
处理探针序列信息	PDF	R脚本
参考手册

biocViews	SequenceMatching，遗传学，基础设施
取决于	R，方法，IRanges
进口	方法，utils，IRanges，Biobase
建议	BSgenome，BSgenome.Celegans.UCSC.ce2，BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3，drosophila2probe，hgu95av2probe，hgu95av2cdf，affy，affydata, RUnit
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL
全靠我	altcdfenvs，BSgenome，gcrma，GeneRegionScan，GGtools，matchprobes，微，ShortRead
进口我	AffyCompatible，BCRANK，biocDatasets，GeneRegionScan，MEDME，oligoClasses，pdInfoBuilder，rtracklayer，ShortRead
建议我	注释，oneChannelGUI，SLGI
发展历史	Bioconductor更新日志