GeneRegionScan

一个包与重点分析的离散区域的基因组。这个包是用于一个或几个基因的调查使用Affymetrix数据,因为它将使用Affymetrix电动工具提取探测器级数据应用和包装ProbeLevelSet这些数据。expressionSet ProbeLevelSet直接扩展,但包括额外的信息每个探针和探针的序列来自。包包含许多功能用于绘制这些探测水平数据沿着mRNA-strands序列位置的函数。可变剪接,这可以用于分析,尤其适合使用exon-array数据。

作者	Lasse Folkersen,迭戈Diez
维护人员	Lasse Folkersen

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“GeneRegionScan”)

文档

GeneRegionScan	PDF	R脚本
参考手册

细节

biocViews	微阵列,DataImport,统计数据,单核苷酸多态性,OneChannel,可视化
取决于	方法,Biobase,Biostrings
进口	Biobase,affxparserRColorBrewer,Biostrings
建议	BSgenome,affy,AnnotationDbi
系统需求
许可证	GPL版本2或更新
URL
取决于我
进口我
建议我
发展历史	Bioconductor更新日志

包下载

包的来源	GeneRegionScan_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	GeneRegionScan_1.0.0.zip
MacOS X 10.4(老虎)二进制	GeneRegionScan_1.0.0.tgz
MacOS X 10.5(豹)二进制	GeneRegionScan_1.0.0.tgz
包下载报告	下载数据