基因组数据分析需要已知基因组信息和新的实验数据的集成可视化。GenomeGraphs使用biomaRt包对Ensembl执行实时注释查询，并将其转换为网格图形包的视口中的基因/转录本结构。这将导致基因组信息与您的数据一起绘制。GenomeGraphs的另一个优点是可以将不同的数据类型，如阵列CGH、基因表达、测序和其他数据，一起绘制在一个图中，使用相同的基因组坐标系统。
| 作者 | 史蒂芬·杜林克，詹姆斯·布拉德 |
| 维护人员 | 史蒂芬Durinck |
要安装这个包，启动R并输入:
源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“GenomeGraphs”)
| 基因组用户指南 | R脚本 | |
|---|---|---|
| 参考手册 |
| biocViews | |
|---|---|
| 取决于 |
方法,biomaRt、网格 |
| 进口 | |
| 建议 | |
| 系统需求 | |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 发展历史 | Bioconductor更新日志 |
| 包的来源 | GenomeGraphs_1.4.1.tar.gz |
|---|---|
| Windows二进制 | GenomeGraphs_1.4.1.zip |
| MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 | GenomeGraphs_1.4.1.tgz |
| MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 | GenomeGraphs_1.4.1.tgz |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |