GlobalAncova

计算全球测试组间差异基因表达

我们给下面的参数支持GlobalAncova方法:适当的正常化后,基因表达数据出现,而对称和离群值没有真正的问题,所以最小二乘应该相当强劲。ANCOVA交互产生饱和数据建模如不同意味着每组和基因。协变量调整可以帮助纠正可能选择偏见。残差方差同质性和不相关的无法预期。普通最小二乘法的应用给予公正的,但不再最优估计(Gauss-Markov-Aitken)。因此,使用经典的野生是不合适的,由于相关性。然而镜子偏离零假设检验统计量。结合一个排列方法,实证意义可以近似水平。另外,一个近似收益率渐近假定值。这项工作是支持的NGFN格兰特01 GR 0459年,德国BMBF。

作者 Mansmann, r·迈斯特·m·胡默尔r . Scheufele s Knueppel的贡献
维护人员 r·迈斯特

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“GlobalAncova”)

文档

GlobalAncova PDF R脚本
GlobalAncovaDecomp PDF R脚本
参考手册

细节

biocViews
取决于
方法、corpcorglobaltest
进口
建议
系统需求
许可证 GPL版本2或更新
URL
取决于我
进口我
建议我
发展历史 Bioconductor更新日志

包下载

包的来源 GlobalAncova_3.10.0.tar.gz
Windows二进制 GlobalAncova_3.10.0.zip
MacOS X 10.4(老虎)二进制 GlobalAncova_3.10.0.tgz
MacOS X 10.5(豹)二进制 GlobalAncova_3.10.0.tgz
包下载报告 下载数据