该包用于检测微阵列芯片上扩展的、扩散的和紧凑的缺陷。Harshlight自动标记芯片集合(affybatch对象)中的区域,并返回一个经过校正的affybatch对象,其中有缺陷的区域用NAs或集合中其他芯片中同一探针值的中值替换。新版本将替换值作为整矩阵处理,解决了内存问题。
作者 | Mayte Suarez-Farinas, Maurizio Pellegrino, Knut M. Wittkowski, Marcelo O. Magnasco |
维护人员 | 莫里吉奥Pellegrino |
要安装这个包,开始R,然后输入:
源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“Harshlight”)
Harshlight | R脚本 | |
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参考手册 |
biocViews | |
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取决于 | |
进口 | |
建议 | |
系统需求 | |
许可证 | GPL版本2或更高版本 |
URL | http://asterion.rockefeller.edu/Harshlight/ |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
发展历史 | Bioconductor更新日志 |
包的来源 | Harshlight_1.14.0.tar.gz |
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Windows二进制 | Harshlight_1.14.0.zip |
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制 | Harshlight_1.14.0.tgz |
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 | Harshlight_1.14.0.tgz |
软件包下载报告 | 下载数据 |