Harshlight

一种微阵列芯片的“校正补偿”程序

该包用于检测微阵列芯片上扩展的、扩散的和紧凑的缺陷。Harshlight自动标记芯片集合(affybatch对象)中的区域,并返回一个经过校正的affybatch对象,其中有缺陷的区域用NAs或集合中其他芯片中同一探针值的中值替换。新版本将替换值作为整矩阵处理,解决了内存问题。

作者 Mayte Suarez-Farinas, Maurizio Pellegrino, Knut M. Wittkowski, Marcelo O. Magnasco
维护人员 莫里吉奥Pellegrino

要安装这个包,开始R,然后输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“Harshlight”)

文档

Harshlight PDF R脚本
参考手册

细节

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系统需求
许可证 GPL版本2或更高版本
URL http://asterion.rockefeller.edu/Harshlight/
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发展历史 Bioconductor更新日志

包下载

包的来源 Harshlight_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 Harshlight_1.14.0.zip
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制 Harshlight_1.14.0.tgz
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 Harshlight_1.14.0.tgz
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