KEGGgraph

KEGGgraph: R和Bioconductor中KEGG通路的图形方法

KEGGGraph是KEGG路径和图形对象之间的接口,也是用于分析、解析和可视化这些图形的工具集合。它将定期更新的KGML (KEGG XML)文件解析为维护所有基本路径属性的图模型。该软件包提供了包括解析、图形操作、可视化等功能。

作者 章继涛,大卫,Stefan Wiemann
维护人员 张季涛

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“KEGGgraph”)

文档

KEGGgraph: KEGG路径的图形方法 PDF R脚本
KEGGgraph应用实例 PDF R脚本
参考手册

细节

biocViews
取决于
方法,XML
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建议
系统需求
许可证 GPL (> = 2)
URL http://www.dkfz.de/en/mga/index.html
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发展历史 Bioconductor更新日志

包下载

包的来源 KEGGgraph_1.1.0.tar.gz
Windows二进制 KEGGgraph_1.1.0.zip
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 KEGGgraph_1.1.0.tgz
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 KEGGgraph_1.1.0.tgz
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