RLMM

Affymetrix SNP阵列的基因型调用算法

基于Affymetrix SNP阵列的多芯片、多SNP方法的分类算法。使用已知基因型标签的大型训练样本,该算法将在新数据上获得更准确的分类结果。RLMM基于一个鲁棒的线性模型,并使用马氏距离进行分类。通过归一化去除芯片间的非生物变异。这种基于模型的算法捕获基因型组和探针之间的相似性,以及数千个其他snp进行准确分类。注意:100K-Xba只在目前。

作者 努斯拉特·拉比,加里·王
维护人员 Nusrat Rabbee

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源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“RLMM”)

文档

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参考手册

细节

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系统需求 内部文件Xba。CQV Xba。区域(或其他区域文件)
许可证 LGPL版本2或更新版本
URL http://www.stat.berkeley.edu/users/nrabbee/RLMM
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发展历史 Bioconductor更新日志

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包的来源 RLMM_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 RLMM_1.6.0.zip
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 RLMM_1.6.0.tgz
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 RLMM_1.6.0.tgz
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