基于Affymetrix SNP阵列的多芯片、多SNP方法的分类算法。使用已知基因型标签的大型训练样本,该算法将在新数据上获得更准确的分类结果。RLMM基于一个鲁棒的线性模型,并使用马氏距离进行分类。通过归一化去除芯片间的非生物变异。这种基于模型的算法捕获基因型组和探针之间的相似性,以及数千个其他snp进行准确分类。注意:100K-Xba只在目前。
作者 | 努斯拉特·拉比,加里·王 |
维护人员 | Nusrat Rabbee |
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源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“RLMM”)
RLMM医生 | R脚本 | |
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参考手册 |
biocViews | |
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取决于 |
R,质量 |
进口 | |
建议 | |
系统需求 | 内部文件Xba。CQV Xba。区域(或其他区域文件) |
许可证 | LGPL版本2或更新版本 |
URL | http://www.stat.berkeley.edu/users/nrabbee/RLMM |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
发展历史 | Bioconductor更新日志 |
包的来源 | RLMM_1.6.0.tar.gz |
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Windows二进制 | RLMM_1.6.0.zip |
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 | RLMM_1.6.0.tgz |
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 | RLMM_1.6.0.tgz |
软件包下载报告 | 下载数据 |