这个包定义了在Affymetrix和Illumina等高通量SNP平台上绘制拷贝数和基因型的类和函数。特别是,SNPchip是oligo包的一个有用的附加组件,用于在预处理后可视化snp水平估计。
作者 | Robert Scharpf和Ingo Ruczinski |
维护人员 | 罗伯特Scharpf |
要安装这个包,启动R并输入:
源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPchip”)
oligoHowTo装饰图案 | R脚本 | |
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SNPchip装饰图案 | R脚本 | |
参考手册 |
biocViews | |
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取决于 |
R,Biobase,方法,oligoClasses、图形 |
进口 | |
建议 |
RSQLite,geneplotter,统计,图形,VanillaICE, RColorBrewer |
系统需求 | |
许可证 | LGPL版本2或更新版本 |
URL | http://www.biostat.jhsph.edu/~iruczins/software/snpchip.html |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
发展历史 | Bioconductor更新日志 |
包的来源 | SNPchip_1.8.0.tar.gz |
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Windows二进制 | SNPchip_1.8.0.zip |
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 | SNPchip_1.8.0.tgz |
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 | SNPchip_1.8.0.tgz |
软件包下载报告 | 下载数据 |