SNPchip

用于高吞吐量SNP芯片数据的类和方法

这个包定义了在Affymetrix和Illumina等高通量SNP平台上绘制拷贝数和基因型的类和函数。特别是,SNPchip是oligo包的一个有用的附加组件,用于在预处理后可视化snp水平估计。

作者 Robert Scharpf和Ingo Ruczinski
维护人员 罗伯特Scharpf

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPchip”)

文档

oligoHowTo装饰图案 PDF R脚本
SNPchip装饰图案 PDF R脚本
参考手册

细节

biocViews
取决于
R,Biobase,方法,oligoClasses、图形
进口
建议
RSQLite,geneplotter,统计,图形,VanillaICE, RColorBrewer
系统需求
许可证 LGPL版本2或更新版本
URL http://www.biostat.jhsph.edu/~iruczins/software/snpchip.html
全靠我
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发展历史 Bioconductor更新日志

包下载

包的来源 SNPchip_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 SNPchip_1.8.0.zip
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 SNPchip_1.8.0.tgz
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 SNPchip_1.8.0.tgz
软件包下载报告 下载数据