用微阵列数据检测差异表达基因。该包可与cDNA微阵列或Affymetrix芯片一起使用。该包适合一个鲁棒的贝叶斯层次模型测试差分表达式。异常值显式地使用$t$-分布建模。该模型包括一个可交换的方差先验,允许不同的基因方差,但仍然缩小极端经验方差。我们的模型可以用于检测多个样本之间的差异表达基因,并且可以在有三个或更多样本时区分不同可能的差异表达模式。参数估计是使用一种新的马尔可夫链蒙特卡洛进行的,适用于该模型将质量放在全参数空间的子空间上。
作者 | 拉斐尔Gottardo |
维护人员 | 拉斐尔Gottardo |
要安装这个包,启动R并输入:
源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“桥”)
桥教程 | R脚本 | |
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参考手册 |
biocViews | |
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取决于 |
R,罗摩
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进口 | |
建议 | |
系统需求 | |
许可证 | GPL版本2或更新 |
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全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
发展历史 | Bioconductor更新日志 |
包的来源 | bridge_1.8.0.tar.gz |
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Windows二进制 | bridge_1.8.0.zip |
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 | bridge_1.8.0.tgz |
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 | bridge_1.8.0.tgz |
软件包下载报告 | 下载数据 |