cosmo搜索一组未对齐的DNA序列对于可能的一个共同的主题,例如,是一个常见的转录因子结合位点。文化基因算法类似,但也允许用户指定的一组约束的位置权重矩阵未知的主题必须满足。这些约束可能包括边界的信息内容在某些地区未知的主题,例如,往往制定先验知识的基础上对转录因子的结构问题。未知的主题宽度、主题事件的分布(哎呀,调制噪声或中医),以及可以选择适当的约束集data-adaptively。
| 作者 | 奥利弗Bembom,费边背带,Sandrine Dudoit |
| 维护人员 | 奥利弗Bembom |
安装这个包,开始R和输入:
源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (cosmo)
| 监督检测守恒的图案与都市性DNA序列 | R脚本 | |
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| 参考手册 |
| biocViews | |
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| 取决于 |
R,方法,跑龙套,seqLogo
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| 进口 | |
| 建议 | |
| 系统需求 | |
| 许可证 | 自由仅用于研究目的。,复制或类型license.cosmo () R。 |
| URL | http://cosmoweb.berkeley.edu/intro.html, http://www.bepress.com/sagmb/vol6/iss1/art8 |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 发展历史 | Bioconductor更新日志 |
| 包的来源 | cosmo_1.10.0.tar.gz |
|---|---|
| Windows二进制 | cosmo_1.10.0.zip |
| MacOS X 10.4(老虎)二进制 | cosmo_1.10.0.tgz |
| MacOS X 10.5(豹)二进制 | cosmo_1.10.0.tgz |
| 包下载报告 | 下载数据 |