gene2pathway

基于InterPro结构域特征的单个基因KEGG通路成员度预测

该软件包获取一个基因列表，并预测每个基因映射到哪个KEGG通路。这是通过观察每个基因的InterPro结构域来完成的。每个预测都被赋予一个置信度分数。该包还允许预测信号通路内基因的连接组件成员。可以训练由KEGG支持的每种生物的单独模型。

作者	Holger Froehlich, Tim Beissbarth贡献
维护人员	Holger Froehlich

要安装这个包，启动R并输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“gene2pathway”)

gene2pathway	PDF	R脚本
参考手册

biocViews	微阵列，生物信息学，分类，GraphsAndNetworks，通路
取决于	R, kernlab，KEGG.db，biomaRt，KEGGSOAP，RBGL，AnnotationDbi，org.Dm.eg.db
进口	SSOAP，RCurl
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系统需求
许可证	GPL (>= 2)
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发展历史	Bioconductor更新日志