HOPACH聚类算法构建集群的层次树递归分区数据集,而排序和可能崩溃在每个水平集群。算法使用均值/中值分割轮廓(MSS)标准确定树的水平,最大限度地均匀集群。它也运行树下生产最后一个元素的有序列表。非参数引导允许一个估计的概率每个元素属于每个集群(模糊聚类)。
作者 | 凯瑟琳·s·波拉德,马克范德朗j .和格雷格墙 |
维护人员 | 凯瑟琳·s·波拉德 |
安装这个包,开始R和输入:
源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“hopach”)
bootplot.pdf | ||
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dplot.pdf | ||
hopach | R脚本 | |
hopachManuscript.pdf | ||
MSS.pdf | R脚本 | |
参考手册 |
biocViews | |
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取决于 |
R,集群,Biobase、方法 |
进口 | |
建议 | |
系统需求 | |
许可证 | GPL版本2或更新 |
URL | http://www.stat.berkeley.edu/ ~拉恩说道/ http://docpollard.com/ |
取决于我 | |
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建议我 | |
发展历史 | Bioconductor更新日志 |
包的来源 | hopach_2.4.0.tar.gz |
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Windows二进制 | hopach_2.4.0.zip |
MacOS X 10.4(老虎)二进制 | hopach_2.4.0.tgz |
MacOS X 10.5(豹)二进制 | hopach_2.4.0.tgz |
包下载报告 | 下载数据 |