rtracklayer

R接口到基因组浏览器及其注释跟踪

可扩展的框架,用于与多个基因组浏览器交互(目前内置UCSC),并以各种格式操作注释轨迹(目前内置GFF、BED和WIG)。用户可以从受支持的浏览器中导出/导入曲目,以及查询和修改浏览器状态,例如当前的视口。

作者 迈克尔•劳伦斯
维护人员 迈克尔•劳伦斯

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“rtracklayer”)

文档

rtracklayer PDF R脚本
参考手册

细节

biocViews
取决于
R,方法,RCurl
进口
建议
系统需求
许可证 艺术- 2.0
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发展历史 Bioconductor更新日志

包下载

包的来源 rtracklayer_1.4.1.tar.gz
Windows二进制 rtracklayer_1.4.1.zip
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 rtracklayer_1.4.1.tgz
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 rtracklayer_1.4.1.tgz
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