simpleaffy

非常简单的Affymetrix数据的高级分析

提供高级函数,用于读取Affy . cel文件、表型数据,然后用它计算简单的东西,如t检验、折叠变化等。大量使用affy库。还具有一些基本的散点图功能和机制,用于生成高分辨率的日志数字…

作者 克里斯宾·J·米勒
维护人员 Crispin米勒

要安装这个包,启动R并输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“simpleaffy”)

文档

QCandSimpleaffy.pdf PDF
simpleaffy底漆 PDF R脚本
参考手册

细节

biocViews
取决于
R,affygenefilterBiobase,方法,utils,gcrma
进口
affyBiobasegcrmagenefilter,图形,grDevices,方法,统计,utils
建议
系统需求
许可证 GPL版本2或更高版本
URL //www.andersvercelli.com, http://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/
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发展历史 Bioconductor更新日志

包下载

包的来源 simpleaffy_2.20.0.tar.gz
Windows二进制 simpleaffy_2.20.0.zip
MacOS X 10.4 (Tiger)二进制文件 simpleaffy_2.20.0.tgz
MacOS X 10.5 (Leopard)二进制文件 simpleaffy_2.20.0.tgz
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