包提供的功能,可用于高密度花砖微阵列数据的分析(如从Affymetrix genechips)测量转录丰度和建筑。包装的主要功能是:1。类“分割”代表分划的一系列线性的数据;2。函数的段拟合分段常数模型使用动态编程算法,既快速又准确的;3所示。函数计算置信区间的confint使用strucchange包;4所示。函数的plotAlongChrom生成漂亮的情节;5。 the function 'normalizeByReference' for probe-sequence dependent response adjustment from a (set of) reference hybridizations.
| 作者 | 徐(Wolfgang Huber Joern Toedling马特·里奇的贡献 |
| 维护人员 | (徐 |
安装这个包,开始R和输入:
源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“tilingArray”)
| 与normalizeByReference功能正常化tilingArray包 | R脚本 | |
|---|---|---|
| 补充。计算成本的矩阵 | R脚本 | |
| 介绍使用分段函数以适应分段常数曲线 | R脚本 | |
| 分割演示 | R脚本 | |
| 参考手册 |
| biocViews | |
|---|---|
| 取决于 |
Biobase、方法、象素映射 |
| 进口 | |
| 建议 | |
| 系统需求 | |
| 许可证 | 艺术许可证,2.0版 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 发展历史 | Bioconductor更新日志 |
| 包的来源 | tilingArray_1.22.0.tar.gz |
|---|---|
| Windows二进制 | tilingArray_1.22.0.zip |
| MacOS X 10.4(老虎)二进制 | tilingArray_1.22.0.tgz |
| MacOS X 10.5(豹)二进制 | tilingArray_1.22.0.tgz |
| 包下载报告 | 下载数据 |