################################################### ### 块1号 : ################################################### 选项(宽度= 70 ) ################################################### ### 块2号 : ################################################### 库(“注释”)数据(sample.ExpressionSet) igenes < - featureNames (sample.ExpressionSet) [246:260 ] ################################################### ### 块3号:################################################### ug < - c(“海关。169284年 // ---", " Hs.268515 / /完整”、“Hs.103419 / /完整”、“Hs.380429 // ---" ,"--- // ---", " Hs.169331 / /完整”、“Hs.381231 / /完整”、“Hs.283781 / /完整 ", "--- // ---", "--- // ---", " Hs.3195 / /完整的长度 ", "--- // ---", " Hs.176660 / /完整”、“Hs.272484 / /完整”、“Hs.372679 / /完整”)将< - c(“221823”、“4330”、“9637年 ", "---", "---", " 6331”、“841”、“27335年 ", "---", "---", " 6375年 ", "---", " 2543”、“2578”、“2215”)gb < - c(“M57423”、“Z70218”,“L17328”、“S81916”、“U63332”、“M77235”、“X98175”,“AB019392”、“J03071”,“D25272”、“D63789”,“D63789”、“U19142”,“U19147”、“X16863”)sp < - c(“P21108”、“Q10571”,“Q9UHY8”、“Q16444 ", "---", " Q14524 / / / Q8IZC9 / / / Q8WTQ6 / / / / / / Q8WWN5 Q96J69”、“Q14790”、“Q9UBQ5 ", "---", "---", " P47992 ", "---", " Q13065 / / / Q8IYC5”、“Q13070”、“O75015 ") ################################################### ### 块数量4:################################################### gb的我 ################################################### ### 块5号 : ################################################### ug ug < -子(“/ /。*”、“美元”,ug) ug ################################################### ### 块6号 : ################################################### sp sp < - strsplit(子 ("---"," ", as.character (sp )), "///") sp ################################################### ### 块7号:expDat ################################################### dat < - exprs (sample.ExpressionSet) [igenes 1:10] FC < - rowMeans (dat (igenes, 1:5))——rowMeans (dat [igenes, 6:10]) pval < esApply(样本。ExpressionSet[igenes,1:10]， 1，函数(x) t.test(x[1:5]， x[6:10])$p.value) tstat <- esApply(样本。ExpressionSet [igenes 1:10] 1、功能(x) t.test (x[1:5],[10])统计 ) ################################################### ### 块8号:###################################################名称<- c(“假设蛋白LOC221823”，“脑膜瘤(在平衡易位中中断)1”，“束结和延伸蛋白zeta 2 (zygin II)”，“磷酸甘油酸激酶{选择性剪接}”，“-”，“钠通道，电压门控，V型，α多肽”，“半胱氨酸蛋白酶8，凋亡相关半胱氨酸蛋白酶”，“肌肉特异性基因”，“-”，“-”，“趋化因子(c基序)配体1”，“-”，“G抗原1”，“G抗原6”，“IgG Fc片段，希望具有低亲和力受体(CD16 )") ################################################### ### 块9号 : ################################################### < - gsub名字的名字 ("---", " ", 名称)名称 ################################################### ### 块10号:buildTable ################################################### genelist <- list(igenes, ug, ll, gb, sp) filename <- "Interesting_genes.html" title <- "An Artificial Set of Interesting Genes" othernames <- list(name, round(tstat, 2)， round(pval, 3)， round(FC, 1)， round(dat, 2)) head <- c("Probe ID"， "UniGene"， "LocusLink"， "GenBank"， "SwissProt"， "Gene name "， "t-statistic"， "p-value"， "Fold Change"， "Sample 1"， "Sample 2"， "Sample 3"， "Sample 4"， "Sample 5"， "Sample 6"， "Sample 7"， "Sample 8"， "Sample 9", "Sample 10") repository <- list("affy", "ug", "en", "gb", "sp") htmlpage(genelist, filename, title, othernames, head, repository = repository) ################################################### ### chunk number 11: ################################################### sessionInfo()