################################################### ### 块1号 : ################################################### 图书馆(“XhybCasneuf ") ################################################### ### 块2号:################################################### ## 所有探头对数据集(AffysTissue)数据(CustomsTissue) # #探针组对基因相互不一致与爆炸创造价值小于10美元^ {-10}$ data (AffysTissue.noBl)数据(CustomsTissue.noBl ) ################################################### ### 块3号 : ################################################### myXs < - c (seq(55, 70,长度。out =3)，seq(75125,length=5)) tiltedmyboxF <- function(X,Y, main){par(mar =c(7,4,4,2) + 0.1) boxplot(Y~X, col = "skyblue2"， ylim=c(-1,1)， ylab = expression(rho[xy])， varwidth=T,xaxt = "n"， cex。主要实验室= 1.4,=主要xlab = " ")轴(1、标签= FALSE)文本(seq_len (nlevels (X)),票面(“usr”)[3]- 0.15,srt = 45岁的n = 1,标签(X) =水平,xpd = TRUE)文本(4,票面价值(“usr”)[3]- 0.6,adj = 1,标签=表达式(Q (xy) ^ 75), xpd = TRUE) abline (0, 0, lty = 2 ) } ################################################### ### 块数量4:################################################### # X11(高度= 10,宽度= 10)布局(矩阵(1:4,nrow = 2, byrow = F)) #所有成对的风俗和affymetrix CDF tiltedmyboxF(削减(myXs AffysTissue alSum美元,包括。最低= TRUE，右= TRUE)， AffysTissue$peCC，主= "A") tiltedmyboxF(cut(CustomsTissue$alSum, myXs，包括。* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *。noBl$alSum, myXs，包括。最低= TRUE，右= TRUE)， AffysTissue。noBl$peCC, main = "C") tiltedmyboxF(cut(CustomsTissue。noBl$alSum, myXs，包括。最低= TRUE，右= TRUE)，自定义问题。peCC noBl美元,主要= " D ") ################################################### ### 块5号 : ################################################### 数据(AffysTissueMC)数据(CustomsTissueMC) myboxplot < -函数(X, Y,主要){箱线图(Y ~ X,坳=“skyblue2 ylim = c (1, 1), ylab =表达式(软木(ρ[X[我]* Y] *[我])),varwidth = T, xaxt =“n”,cex。lab = 1.4, main = main, xlab =expression(Q[xy]^75)) axis(1, labels = FALSE) text(seq_len(nlevels(X))+0.25, par("usr")[3] - 0.12, srt = 20, adj = 1, labels = levels(X)， xpd = TRUE) abline(0,0, lty=2)} par(mfrow=c(1,2)) #所有Affymetrix CDF X <- cut(AffysTissueMC$alSum, myXs，包括。low = TRUE, right = TRUE) myboxplot(X, AffysTissueMC$Mcor, main = "A") #所有对定制CDF X <- cut(CustomsTissueMC$alSum, myXs，包括。最低= TRUE,右= TRUE) myboxplot (X, CustomsTissueMC泥浆校正美元,主要= " B ") ################################################### ### 块6号 : ################################################### 数据(例1)plotExample(例1 ) ################################################### ### 块7号 : ################################################### 数据(ex2) plotExample (ex2 ) ################################################### ### 块8号: ################################################### data(ex3) plotExample(ex3) ################################################### ### chunk number 9: ################################################### runSimulation()