RpsiXML

PSI-MI 2.5 R接口文件

Bioconductor版本:2.5

查询,数据结构和接口交互的可视化数据集。这个包inplements PSI-MI 2.5标准和支持到现在8数据库。进一步的数据库支持PSI-MI 2.5标准将不断增加。

作者:大卫•张Jitao Stefan Wiemann马克•卡尔森托尼蒋介石的贡献

维修工:Jitao大卫张< j。张在dkfz.de >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“RpsiXML”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“RpsiXML”)

文档

PDF	R脚本	RpsiXML方案的应用实例
PDF	R脚本	阅读PSI-25 XML文件
PDF		参考手册

细节

biocViews	基础设施,蛋白质组学
取决于	方法,注释(> = 1.21.0),图(> = 1.21.0),Biobase,RBGL(> = 1.17.0),XML(> =测试盒框),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi
进口
建议	org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,hom.Hs.inp.db,hom.Mm.inp.db,hom.Dm.inp.db,hom.Rn.inp.db,hom.Sc.inp.db,Rgraphviz,ppiStats
系统需求
许可证	LGPL-3
URL	//www.andersvercelli.com
取决于我	ScISI
进口我	ScISI
建议我
版本	1.6.0
自	Bioconductor 2.3 (r - 2.8)

包下载

包的来源	RpsiXML_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	RpsiXML_1.6.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	RpsiXML_1.6.0.tgz
包下载报告	下载数据