nem

嵌套效应模型重建表型层次

Bioconductor版本:2.5

“nem”包允许从微扰效应的嵌套结构中重建路径的特征。它将(1)一组受到干扰的通路成分，以及(2)这些扰动的高维表型读数(例如基因表达或形态谱)作为输入。输出是一个有向图，表示表型层次结构。

作者:Holger Froehlich, Florian Markowetz, Achim Tresch, Christian Bender, Matthias Maneck, Claudio Lottaz, Tim Beissbarth

维护者:Christian Bender

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源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite (nem)

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引用(nem)

文档

PDF		markowetz -论文- 2006. - pdf
PDF	R脚本	嵌套效应模型——以果蝇免疫反应为例
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，生物信息学，GraphsAndNetworks，通路
取决于	R (>= 2.0)，e1071(> = 1.5),图(> = 1.10),Rgraphviz(> = 1.10),plotrix
进口	引导，e1071，图、图形、grDevices、方法、RBGL(> = 1.8.1),RColorBrewer，Rgraphviz，统计，utils
建议	Biobase(> = 1.10)
系统需求
许可证	GPL (>= 2)
URL	//www.andersvercelli.com
这取决于我
进口我
建议我
版本	2.10.0
自	Bioconductor 1.9 (R-2.4)

包下载

包的来源	nem_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	nem_2.10.0.zip(32- & 64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	nem_2.10.0.tgz
软件包下载报告	下载数据