GeneticsBase

类和函数来处理基因数据

Bioconductor版本:2.6

R基因项目是一个合作开发一套完整的工具用于存储、访问、操纵,并分析遗传学数据,从小型候选基因研究几个遗传标记组成的大型全基因组研究包含成千上万的标记。这个包(GeneticsBase)提供了一种高效的数据结构和易于使用的操作函数的基础。

作者:格雷戈里警告<警告bst.rochester.edu >罗斯拉撒路<罗斯。拉撒路在channing.harvard.edu >斯科特·D Chasalow <斯科特。chasalow bms.com >乔凡尼蒙大拿<乔凡尼。蒙大拿bms.com >迈克尔·奥康奈尔< moconnell insightful.com >表示成< jcheng8 users.sourceforge.net > Nitin Jain <尼。耆那教的pfizer.com >

维护人员:R基因项目< r-genetics-talk lists.sourceforge.net >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“GeneticsBase”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“GeneticsBase”)

文档

PDF		CAMP_alleleSummary_html.pdf
PDF		CAMP_genotypeSummary_html.pdf
PDF		CAMP_LD_html.pdf
PDF	R脚本	HOWTO:基因型数据加载
PDF	R脚本	汇总表
PDF	R脚本	汇总表
PDF		参考手册

细节

biocViews	遗传学
取决于	R(> = 2.3.1)、方法combinat
进口	gdata(> = tripwire),gplots(> = 2.3.1),gtools(> = 2.2.3)、图形grDevices,方法,属性,跑龙套,xtable
建议	GeneticsDesign,fbat
系统需求
许可证	LGPL
URL
取决于我	fbat
进口我	fbat
建议我
版本	1.14.0
自	Bioconductor 2.0 (r - 2.5)

包下载

包的来源	GeneticsBase_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	GeneticsBase_1.14.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	GeneticsBase_1.14.0.tgz
包下载报告	下载数据