fbat

基于家族的遗传数据关联测试。

Bioconductor版本:2.6

这个包实现了广泛的一类基于家族的遗传数据关联测试，使用来自“FBAT”软件程序的代码对种群混合进行调整(见http://www.biostat.harvard.edu/~fbat/fbat.htm)。特征包括:-使用来自核心家庭、兄弟姐妹、血统或任何组合的数据;提供无偏倚的测试与创始人基因型或不。-分析二分的，测量的，或时间到发病的性状和多个性状;特征定义可以优化。-提供使用标准遗传模型(加性、显性、隐性或基因型)的双等位基因和多等位基因关联测试。-提供大样本和原假设的蒙特卡罗精确检验:无联系和无关联;提供H0的大样本检验:无关联。-估计等位基因频率;检验孟德尔一致性。 - Tests multiple markers using haplotypes; estimates haplotype frequencies and linkage disequilibrium between pairs of markers. - Offers two multi-marker tests for testing multiple markers simultaneously, without resolving phase or assuming no recombination. - Uses standard pedigree data files; phenotype file is optional. - Offers the Sibs Disequilibrium Test.

作者:邱伟良 Ross Lazarus < Ross。lazarus at channing.harvard.edu> Gregory Warnes < Warnes at bst.rochester.edu> Nitin Jain < Nitin。Jain在pfizer.com>

维护人员:R Genetics Project < R Genetics -talk at lists.sourceforge.net>

要安装这个包，开始R，然后输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“fbat”)

要在发布中引用此包，请开始R并输入:

引用(“fbat”)

文档

PDF	R脚本	基于家族的关联测试使用\Rpackage{fbat
PDF		参考手册

细节

biocViews	遗传学
取决于	GeneticsBase
进口	GeneticsBase，质量，统计，效用
建议
系统需求
许可证	LGPL
URL
全靠我
进口我
建议我	GeneticsBase
版本	1.12.0
自	生物导体2.0 (R-2.5)

包下载

包的来源	fbat_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	fbat_1.12.0.zip(32- & 64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	fbat_1.12.0.tgz
软件包下载报告	下载数据