rGADEM

新创主题发现

Bioconductor版本:2.6

rGADEM是一种有效的新创主题发现大规模基因组序列数据的工具。它是一个开源R包,它是基于GADEM软件。

作者:Arnaud所有权,拉斐尔Gottardo戈登·罗伯逊和莱普

维护人员:Arnaud所有权< Arnaud。所有权在ircm.qc.ca >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“rGADEM”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“rGADEM”)

文档

PDF	R脚本	rGADEM用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,ChIPchip,测序,ChIPSeq,GenomicSequence
取决于	R (> = 2.11.0),Biostrings,IRanges,BSgenome、方法、seqLogo
进口	Biostrings,IRanges、方法、图形seqLogo
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL
取决于我
进口我	MotIV
建议我
版本	1.0.1
自	Bioconductor 2.6 (r - 2.11)

包下载

包的来源	rGADEM_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	rGADEM_1.0.1.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	rGADEM_1.0.1.tgz
包下载报告	下载数据