ADaCGH2

从aCGH实验分析数据使用并行计算和ff对象

Bioconductor版本:2.7

全息阵列数据的分析和策划。允许使用循环二进制Segementation,小波平滑(如刘et al .,和HaarSeg Ben-Yaacov和灵族),嗯,BioHMM,欢喜,CGHseg。大多数计算并行化。

作者:雷蒙Diaz-Uriarte < rdiaz02 gmail.com >,奥斯卡·m·达<埃达。om gmail.com >。小波aCGH平滑代码从李许< lih fhcrc.org >和道格拉斯格罗夫< dgrove fhcrc.org >。Imagemap代码从巴里Rowlingson < B。Rowlingson lancaster.ac.uk >。HaarSeg代码从Erez Ben-Yaacov;从< http://www.ee.technion.ac.il/people/YoninaEldar/Info/software/HaarSeg.htm >下载

维护人员:雷蒙Diaz-Uriarte < rdiaz02 gmail.com >

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源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“ADaCGH2”)

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引用(“ADaCGH2”)

文档

PDF	R脚本	ADaCGH2概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,CopyNumberVariants
取决于	R (> = 2.11.0),tilingArray,aCGH,waveslim,集群,snapCGH,降雪,ff
进口
建议	很高兴,DNAcopy,CGHregions,rlecuyer
系统需求
许可证	GPL (> = 3)
URL	http://launchpad.net/adacgh, http://wavicgh.bioinfo.cnio.es
取决于我
进口我
建议我
版本	1.0.0
自	Bioconductor 2.7 (r - 2.12)

包下载

包的来源	ADaCGH2_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	ADaCGH2_1.0.0.zip(32位)
MacOS 10.5(豹)二进制	ADaCGH2_1.0.0.tgz
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