生物导体版本:2.7
该软件包为蛋白质 - 蛋白质相互作用网络的集成分析和功能模块的检测提供了功能。可以通过将统计测试的p值分配给网络节点来集成到网络中。例如。从Affymetrix阵列的基因的差分表达获得的P值分配给网络节点。通过拟合β-均匀的混合模型并计算来自p值的得分,可以计算网络区域的整体得分,并且整数线性编程算法可以识别最大评分子网络。
作者:Marcus Dittrich和Daniela Beisser
维护者:marcus dittrich
要安装此软件包,请启动R并输入:
来源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ bionet”)
要在出版物中引用此软件包,请启动R并输入:
引用(“ Bionet”)
R脚本 | Bionet教程 | |
cytoscape.pdf | ||
prec_recall_large.pdf | ||
prec_recall_small.pdf | ||
Tutorial-3DPlot.pdf | ||
参考手册 |
生物浏览 | 微阵列,,,,DataImport,,,,GraphSandNetworks,,,,可视化,,,,生物信息学,,,,基因表达,,,,差异性 |
要看 | r(> = 2.11.0),生物酶,,,,图形,,,,rbgl |
进口 | Igraph,,,,XML,,,,AnnotationDbi |
建议 | RGL,,,,算,,,,DLBCL,,,,GeneFilter,,,,Xtable,,,,全部,,,,林玛,,,,HGU95AV2.DB |
系统要求 | |
执照 | GPL(> = 2) |
URL | http://bionet.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/ |
取决于我 | HTSANALYZER |
进口我 | HTSANALYZER |
建议我 | |
版本 | 1.8.0 |
自从 | 生物导体2.7(R-2.12) |
包源 | Bionet_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | bionet_1.8.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.5(豹)二进制 | Bionet_1.8.0.tgz |
软件包下载报告 | 下载统计 |