Bionet

生物网络功能分析的常规

生物导体版本:2.7

该软件包为蛋白质 - 蛋白质相互作用网络的集成分析和功能模块的检测提供了功能。可以通过将统计测试的p值分配给网络节点来集成到网络中。例如。从Affymetrix阵列的基因的差分表达获得的P值分配给网络节点。通过拟合β-均匀的混合模型并计算来自p值的得分,可以计算网络区域的整体得分,并且整数线性编程算法可以识别最大评分子网络。

作者:Marcus Dittrich和Daniela Beisser

维护者:marcus dittrich

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来源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ bionet”)

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引用(“ Bionet”)

文档

PDF R脚本 Bionet教程
PDF cytoscape.pdf
PDF prec_recall_large.pdf
PDF prec_recall_small.pdf
PDF Tutorial-3DPlot.pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,DataImport,,,,GraphSandNetworks,,,,可视化,,,,生物信息学,,,,基因表达,,,,差异性
要看 r(> = 2.11.0),生物酶,,,,图形,,,,rbgl
进口 Igraph,,,,XML,,,,AnnotationDbi
建议 RGL,,,,,,,,DLBCL,,,,GeneFilter,,,,Xtable,,,,全部,,,,林玛,,,,HGU95AV2.DB
系统要求
执照 GPL(> = 2)
URL http://bionet.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/
取决于我 HTSANALYZER
进口我 HTSANALYZER
建议我
版本 1.8.0
自从 生物导体2.7(R-2.12)

软件包下载

包源 Bionet_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 bionet_1.8.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制 Bionet_1.8.0.tgz
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