CSAR

用于分析芯片序列数据的统计工具

生物导体版本：2.7

CHIP-SEQ数据分析的统计工具。该软件包包括Kaufmann等人中描述的统计方法。（2009）PLOS生物学：7（4）：E1000090。简而言之，该软件计算出基因组单核苷酸读取值的平均DNA片段大小。归一化后，使用基于泊松分布的测试比较样品和对照。测试统计阈值控制错误的发现率是通过随机排列获得的。

作者：Jose M Muino

维护者：Jose M Muino

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来源（“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”）bioclite（“ csar”）

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引用（“ CSAR”）

文档

PDF	R脚本	CSAR VIGNETTE
PDF		参考手册

细节

生物浏览	chipseq，，，，转录，，，，遗传学
要看	R（> = 2.6.0）
进口	统计，utils
建议	Shortread，，，，生物弦
系统要求
执照	艺术2.0
URL
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版本	1.2.0
自从	生物导体2.6（R-2.11）

软件包下载

包源	csar_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	csar_1.2.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.5（豹）二进制	csar_1.2.0.tgz
软件包下载报告	下载统计