degraph

图上的两样本测试

生物导体版本：2.7

Degraph实施了最新的假设检验方法，该方法直接评估了在两个条件之间是否差异表达特定基因网络。这将与更古典的两步方法进行对比，该方法首先测试了单个基因，然后测试基因集以在差异表达的基因中富集。这些最近的方法考虑了网络的拓扑结构，以产生更强大的检测程序。Degraph提供了轻松测试所有基因表达数据集的差分表达的方法，以及可视化结果的工具。

作者：Laurent Jacob，Pierre Neuvial和Sandrine Dudoit

维护者：laurent Jacob

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来源（“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”）bioclite（“ degraph”）

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引用（“ degraph”）

文档

PDF	R脚本	DEGRAPH：基因网络的差异表达测试
PDF		参考手册

细节

生物浏览	微阵列，，，，生物信息学，，，，差异性，，，，GraphSandNetworks
要看	r（> = 2.10.0），r.utils
进口	图形，，，，kegggraph，，，，格子，，，，mvtnorm，，，，R.Methodss3，，，，rbgl，，，，rgraphviz，，，，rrcov
建议	公司，，，，字段，，，，图形，，，，kegggraph，，，，格子，，，，Marray，，，，rbgl，，，，rrcov，，，，rgraphviz
系统要求
执照	GPL-3
URL
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版本	1.0.0
自从	生物导体2.7（R-2.12）

软件包下载

包源	degraph_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制	degraph_1.0.0.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.5（豹）二进制	degraph_1.0.0.0.tgz
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