iranges

用于操纵序列间隔的基础架构

生物导体版本:2.7

该软件包为存储整数,RLE向量(运行长度编码)以及更一般而言,可以顺序组织的数据以及对这些序列的视图提供了有效的低级和高度可重复使用的S4类。还提供了有效的类似列表的类,用于存储基本类的大量实例。包装中的所有类都使用一致的命名,并尽可能分享相同的丰富和一致的“序列API”。

作者:H。Pages,P。Aboyoun和M. Lawrence

维护者:Biocore团队C/O Bioc用户列表的BioConductor

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文档

PDF R脚本 iranges简介
PDF R脚本 提示和技巧
PDF 参考手册

细节

生物浏览 基础设施,,,,datarepresentation
要看 r(> = 2.8.0),方法,utils,stats
进口 方法,utils,统计
建议 运行
系统要求
执照 艺术2.0
URL
取决于我 BayEspeak,,,,生物数据集,,,,生物弦,,,,BSGENOME,,,,Chippeakanno,,,,chipseq,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,Genominator,,,,ggtools,,,,girafe,,,,港口,,,,Onechannelgui,,,,图片,,,,rgadem,,,,rmat,,,,rsamtools,,,,Shortread,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109,,,,香草,,,,Xmapcore
进口我 BayEspeak,,,,生物数据集,,,,生物弦,,,,魅力,,,,Chippeakanno,,,,chipseq,,,,chipseqr,,,,芯片,,,,ChromheatMap,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,ggtools,,,,Medips,,,,甲基类,,,,动机,,,,耳管酶,,,,pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1,,,,PD.2006.07.18.hg18.refseq.promoter,,,,PD.2006.07.18.mm8.refseq.promoter,,,,PD.2006.10.31.RN34.REFSEQ.PROMOTER,,,,pd.charm.hg18.example,,,,pd.cytegenetics.array,,,,pd.feinberg.hg18.me.hx1,,,,pd.feinberg.mm8.me.hx1,,,,pd.Genomewidenp.5,,,,pd.Genomewidenp.6,,,,pd.hg.u95a,,,,pd.hg.u95av2,,,,pd.ht.hg.u133.plus.pm,,,,pd.huex.1.0.st.v2,,,,pd.hugene.1.0.st.v1,,,,pd.hugene.1.1.st.v1,,,,pd.mapping250k.nsp,,,,pd.mapping250k.Sty,,,,pd.mapping50k.hind240,,,,pd.mapping50k.xba240,,,,pd.moex.1.0.st.v1,,,,pd.mogene.1.0.st.v1,,,,pd.mogene.1.1.st.v1,,,,PD.Mouse430.2,,,,pd.raex.1.0.st.v1,,,,pd.ragene.1.0.st.v1,,,,pd.ragene.1.1.st.v1,,,,pdinfobuilder,,,,图片,,,,R453plus1toolbox,,,,rgadem,,,,rmat,,,,RNASEQMAP,,,,劳力士,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,片段,,,,Shortread,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109
建议我 希尔伯特维斯,,,,Hilbertvisgui,,,,Onechannelgui,,,,yeastrnaseq
版本 1.8.9
自从 生物导体2.3(R-2.8)

软件包下载

包源 iranges_1.8.9.tar.gz
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弗雷德·哈钦森癌症研究中心