生物导体版本:2.7
Kegggraph是Kegg途径和图对象之间的接口,也是分析,剖析和可视化这些图形的工具集合。它将定期更新的KGML(KEGG XML)文件解析为维护所有基本途径属性的图形模型。该软件包提供功能,包括解析,图形操作,可视化和等。
作者:Jitao David Zhang和Stefan Wiemann
维护者:Jitao David Zhang
要安装此软件包,请启动R并输入:
来源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ kegggraph”)
要在出版物中引用此软件包,请启动R并输入:
引用(“ kegggraph”)
R脚本 | kegggraph:应用程序示例 | |
R脚本 | kegggraph:kegg途径的图形方法 | |
参考手册 |
生物浏览 | 途径,,,,GraphSandNetworks |
要看 | 方法,XML(> = 2.3-0),图形,,,,rgraphviz(> = 1.22.0) |
进口 | 方法,XML,,,,图形 |
建议 | rbgl,,,,kegg.db,,,,org.hs.eg.db,,,,hgu133plus2.db,,,,Spia |
系统要求 | |
执照 | GPL(> = 2) |
URL | http://www.dkfz.de/en/mga/index.html |
取决于我 | |
进口我 | degraph |
建议我 | degraph,,,,Spia |
版本 | 1.6.0 |
自从 | 生物导体2.4(R-2.9) |
包源 | kegggraph_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | kegggraph_1.6.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.5(豹)二进制 | kegggraph_1.6.0.tgz |
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