量规

通常适用于途径分析的基因 - 富集

生物导体版本:2.7

GAGE是一种用于基因集或途径分析的已发表方法。在GAGE软件包中,我们提供了一系列用于基本量规分析,结果处理和呈现的功能。我们还为不同的比较或样品,平行分析结果的比较,甚至对来自不同来源/研究的异质数据的组合分析构建了多个量规分析的管道例程。此外,我们还提供了基于KEGG途径和GO术语的常用基因集数据和常用的基因集数据。这些功能和数据也可用于使用其他方法的基因集分析。

作者:Weijun Luo

维护者:weijun luo

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来源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ gage”)

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文档

PDF R脚本 通常适用的基因组/途径分析
PDF 参考手册

细节

生物浏览 途径,,,,,,,,差异性,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,两通道,,,,rnaseq,,,,datarepresentation,,,,遗传学,,,,生物信息学,,,,多蛋白酶
要看 图形,,,,多检验
进口
建议 Gagedata,,,,go.db,,,,gseabase,,,,kegg.db,,,,org.hs.eg.db
系统要求
执照 GPL(> = 2.0)
URL
取决于我
进口我
建议我 Gagedata
版本 2.0.0
自从 生物导体2.7(R-2.12)

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