生物导体版本:2.7
GAGE是一种用于基因集或途径分析的已发表方法。在GAGE软件包中,我们提供了一系列用于基本量规分析,结果处理和呈现的功能。我们还为不同的比较或样品,平行分析结果的比较,甚至对来自不同来源/研究的异质数据的组合分析构建了多个量规分析的管道例程。此外,我们还提供了基于KEGG途径和GO术语的常用基因集数据和常用的基因集数据。这些功能和数据也可用于使用其他方法的基因集分析。
作者:Weijun Luo
维护者:weijun luo
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来源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ gage”)
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引用(“盖奇”)
R脚本 | 通常适用的基因组/途径分析 | |
参考手册 |
生物浏览 | 途径,,,,去,,,,差异性,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,两通道,,,,rnaseq,,,,datarepresentation,,,,遗传学,,,,生物信息学,,,,多蛋白酶 |
要看 | 图形,,,,多检验 |
进口 | |
建议 | Gagedata,,,,go.db,,,,gseabase,,,,kegg.db,,,,org.hs.eg.db |
系统要求 | |
执照 | GPL(> = 2.0) |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | Gagedata |
版本 | 2.0.0 |
自从 | 生物导体2.7(R-2.12) |
包源 | gage_2.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | gage_2.0.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.5(豹)二进制 | gage_2.0.0.tgz |
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