Gene2Pathway

基于Interpro域特征的单个基因的KEGG途径成员资格的预测

生物导体版本：2.7

该软件包列出了一个基因列表，并预测每个基因映射到哪个KEGG途径。这是通过查看每个基因的间域域来完成的。每个预测都分配了置信度得分。该软件包还允许预测信号通路中基因的连接组件成员资格。可以训练由KeGG支持的每个生物的单独模型。

作者：holger froehlich ，蒂姆·比斯巴斯（Tim Beissbarth）的贡献

维护者：holger froehlich

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来源（“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”）bioclite（“ gene2pathway”）

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引用（“ Gene2Pathway”）

文档

PDF	R脚本	Gene2Pathway
PDF		参考手册

细节

生物浏览	微阵列，，，，生物信息学，，，，分类，，，，GraphSandNetworks，，，，途径
要看	r（> = 2.10.0），克恩拉布（> = 0.9），Biomart（> = 1.12.1），keggsoap（> = 1.12.0），rbgl，，，，AnnotationDbi，，，，org.dm.eg.db，，，，Keggorthology（> = 2.0）
进口	Ssoap，rcurl
建议
系统要求
执照	GPL（> = 2）
URL
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版本	1.8.1
自从	生物导体2.4（R-2.9）

软件包下载

包源	Gene2Pathway_1.8.1.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.5（豹）二进制	Gene2Pathway_1.8.1.tgz
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