xcms

LC/MS和GC/MS数据分析

Bioconductor版本:2.7

色谱分离和单光谱质谱数据的处理和可视化框架。从AIA/ANDI NetCDF, mzXML, mzData和mzML文件导入。预处理数据，用于高通量，非目标分析物分析。

作者:Colin A. Smith ， Ralf Tautenhahn ， Steffen Neumann ， Paul Benton

维护者:Colin A. Smith

要安装这个包，开始R，然后输入:

源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“xcms”)

要在发布中引用此包，请开始R并输入:

引用(“xcms”)

文档

PDF		FlowChart.pdf
PDF	R脚本	用xcms对FTICR-MS数据进行分组
PDF	R脚本	xcms安装说明
PDF	R脚本	用xcms进行LC/MS预处理与分析
PDF	R脚本	用xcms处理串联MS和MS$^n$数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	技术，MassSpectrometry
取决于	R(>= 1.9.0)，方法
进口
建议	faahKO，msdata，乘，ncdf，rgl，MassSpecWavelet(> = 1.5.2),RANN，雪，KEGGSOAP
系统需求	NetCDF, zlib
许可证	GPL (> = 2)
URL	http://metlin.scripps.edu/download/
取决于我	相机，TargetSearch
进口我	相机，flagme
建议我	faahKO，MassSpecWavelet，msdata
版本	1.24.1
自	Bioconductor 1.6 (R-2.1)或更早版本

包下载

包的来源	xcms_1.24.1.tar.gz
Windows二进制	xcms_1.24.1.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	xcms_1.24.1.tgz
包下载报告	下载数据