################################################### ### 块1号 : ################################################### 库(sscore)选项(宽度= 60)库(affydata ) ################################################### ### 块2号:################################################### 数据(稀释)# #获得数据的示例# #包的路径目录路径名< -执行(“医生”,包=“sscore”)玻璃纸< -稀释(c(1、3))# # sscore只需要第一个2样品/条件。基本的< - SScore (celfile玻璃纸。路径=路径名,科幻小说= c (4.46, 5.72), SDT = c (57.241, 63.581), rm.extra = FALSE ) ################################################### ### 块3号 : ################################################### exprs (SScore.basic) [1:20 ] ################################################### ### 块4号 : ################################################### 标签< - c (0, 0, 0, 1, 1, 1 ) ################################################### ### 块5号:################################################### 数据(稀释)路径名< -执行(“医生”,包=“sscore”)玻璃纸< -稀释sscore。多< - SScore(玻璃纸,classlabel = c(0, 0, 1, 1),科幻小说= c (4.46, 6.32, 5.72, 9.22), SDT = c (57.241, 53.995, 63.581, 69.636), celfile.path =路径名,rm.extra = FALSE ) ################################################### ### 块6号 : ################################################### exprs (SScore.multi) [1:20 ] ################################################### ### 块7号:################################################### 数据(稀释)路径名< -执行(“医生”,包=“sscore”)比较< -矩阵(c(1、2、1,3,4),ncol = 2, byrow = TRUE) SScoreBatch。基本的< - SScoreBatch(比较=比较稀释,科幻小说= c (4.46, 6.32, 5.72, 9.22), SDT = c (57.241, 53.995, 63.58,169.636), celfile.path =路径名,rm.extra = FALSE ) ################################################### ### 块8号 : ################################################### exprs (SScoreBatch.basic) [1:10 ,] ################################################### ### 块数量9:################################################### sscores < - exprs (SScore.basic) # # # #提取S-Score值找到那些大于3 SD signif < - geneNames(稀释)[abs (sscores) > = 3 ] ################################################### ### 块10号 : ################################################### sscores < - exprs (SScore.basic) # #提取p.values S-Score值。1 <- 1 - pnorm(abs(sscores)) ##查找相应的##片面的p-values。2 <- 2*(1 - pnorm(abs(sscores))) ##查找相应的##双面p值