################################################### ### 块1号:LibraryPreload ################################################### 库(xcms)库(msdata ) ################################################### ### 块2号:RawFiles ################################################### mzdatapath < -系统。文件("iontrap"， package = "msdata")列表。文件(mzdatapath,递归= TRUE ) ################################################### ### 块3号:FileIO ################################################### 库(xcms) mzdatafiles < -列表。文件(mzdatapath,模式= "提取。mzData”、递归= TRUE full.names = TRUE) xraw < - xcmsRaw (mzdatafiles [1], includeMSn = TRUE) xraw ################################################### ### 块数量4:SpectraSelection ################################################### 山峰< - findPeaks (xraw方法= " MS1 ") ################################################### ### 块5号:SpectraSelection ################################################### x < - xcmsSet (mzdatafiles、方法=“MS1”)xfrag < - xcmsFragments xfrag (x) ################################################### ### 块6号:TreePlot ################################################### plotTree (xfrag xcmsFragmentPeakID = 6 ) ################################################### ### 块7号:TextTree ################################################### plotTree (xfrag xcmsFragmentPeakID = 6, textOnly = TRUE)