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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ bioStrings”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

生物弦

该软件包适用于生物导体的2.8版;对于稳定的最新版本,请参阅生物弦

表示生物序列和匹配算法的弦对象

生物导体版本:2.8

内存有效的字符串容器,匹配算法和其他实用程序的字符串容器,用于快速操纵大型生物序列或一组序列。

作者:H。Pages,P。Aboyoun,R。Gentleman和S. Debroy

维护者:H。页面>

引用(从r内,输入引用(“生物弦”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“生物弦”)

PDF Alignments.pdf
PDF BioStrings2Classes.pdf
PDF matchprobes.pdf
PDF 乘法。pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,遗传学,,,,基础设施,,,,测序,,,,测序,,,,软件
版本 2.20.4
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 11年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 2.8.0),方法,iranges(> = 1.10.2)
进口 图形,方法,统计,utils,iranges
链接 iranges
建议 BSGENOME(> = 1.13.14),bsgenome.celegans.ucsc.ce2(> = 1.3.11),bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3(> = 1.3.11),果蝇2企业,,,,HGU95AV2Probe,,,,HGU133PROBE,,,,GenomicFeatures(> = 1.3.14),HGU95AV2CDF,,,,副词,,,,Affydata(> = 1.11.5),运行
系统要求
增强 rmpi
URL
取决于我 altcdfenvs,,,,BSGENOME,,,,Chippeakanno,,,,芯片,,,,Generegionscan,,,,港口,,,,甲基类,,,,R453plus1toolbox,,,,rgadem,,,,rsamtools,,,,seqbias,,,,Shortread
进口我 AffyCompatible,,,,arrayexpresshts,,,,Bcrank,,,,BioseqClass,,,,魅力,,,,Chippeakanno,,,,chipseqr,,,,芯片,,,,GCRMA,,,,Generegionscan,,,,GenomicFeatures,,,,girafe,,,,Medips,,,,Medme,,,,甲基类,,,,microRNA,,,,奥利戈,,,,寡群,,,,耳管酶,,,,pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1,,,,PD.2006.07.18.hg18.refseq.promoter,,,,PD.2006.07.18.mm8.refseq.promoter,,,,PD.2006.10.31.RN34.REFSEQ.PROMOTER,,,,pd.ag,,,,pd.barley1,,,,pd.bovine,,,,pd.bsubtilis,,,,pd,,,,pd.canine.2,,,,pd.celegans,,,,pd.charm.hg18.example,,,,pd.Chicken,,,,pd.Citrus,,,,PD.Cotton,,,,pd.cytegenetics.array,,,,pd.Drosgenome1,,,,PD.Drosophila.2,,,,PD.E.COLI.2,,,,pd.ecoli,,,,pd.ecoli.asv2,,,,pd.feinberg.hg18.me.hx1,,,,pd.feinberg.mm8.me.hx1,,,,pd.Genomewidenp.5,,,,pd.Genomewidenp.6,,,,PD.HC.G110,,,,pd.hg.Focus,,,,pd.hg.u133.plus.2,,,,pd.hg.u133a,,,,pd.hg.u133a.2,,,,pd.hg.u133a.tag,,,,pd.hg.u133b,,,,pd.hg.u219,,,,pd.hg.u95a,,,,pd.hg.u95av2,,,,pd.hg.u95b,,,,pd.hg.u95c,,,,pd.hg.u95d,,,,pd.hg.u95e,,,,pd.ht.hg.u133.plus.pm,,,,pd.ht.hg.u133a,,,,pd.ht.mg.430a,,,,pd.hu6800,,,,pd.huex.1.0.st.v2,,,,pd.hugene.1.0.st.v1,,,,pd.hugene.1.1.st.v1,,,,pd.maize,,,,pd.mapping250k.nsp,,,,pd.mapping250k.Sty,,,,pd.mapping50k.hind240,,,,pd.mapping50k.xba240,,,,pd.Medicago,,,,pd.mg.u74a,,,,pd.mg.u74av2,,,,pd.mg.u74b,,,,pd.mg.u74bv2,,,,pd.mg.u74c,,,,pd.mg.u74cv2,,,,pd.mirna.1.0,,,,pd.moe430a,,,,pd.moe430b,,,,pd.moex.1.0.st.v1,,,,pd.mogene.1.0.st.v1,,,,pd.mogene.1.1.st.v1,,,,PD.Mouse430.2,,,,PD.Mouse430a.2,,,,pd.mu11ksuba,,,,pd.mu11ksubb,,,,pd.pae.g1a,,,,pd.plasmodium.anopheles,,,,PD.Poplar,,,,pd.porcine,,,,PD.RAE230A,,,,PD.RAE230b,,,,pd.raex.1.0.st.v1,,,,pd.ragene.1.0.st.v1,,,,pd.ragene.1.1.st.v1,,,,PD.RAT230.2,,,,pd.rg.u34a,,,,pd.rg.u34b,,,,pd.rg.u34c,,,,pd.RESUS,,,,pd.rice,,,,PD.RN.U34,,,,pd.s.aureus,,,,pd.soybean,,,,pd.sugar.cane,,,,pd.tomato,,,,pd.u133.x3p,,,,pd.Vinifera,,,,pd.wheat,,,,pd.x.laevis.2,,,,pd.x.tropicalis,,,,pd.xenopus.laevis,,,,pd.yeast.2,,,,pd.yg.s98,,,,pd.zebrafish,,,,pdinfobuilder,,,,R453plus1toolbox,,,,rgadem,,,,劳力士,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,Shortread
建议我 注释,,,,CSAR,,,,GenomicFeatures,,,,microRNA,,,,Onechannelgui,,,,Procoil,,,,Slgi,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20090506,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 BioStrings_2.20.4.4.tar.gz
Windows二进制 BioStrings_2.20.4.4.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/biostrings/tree/release-2.8
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/biostrings/
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