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DESeq
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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DESeq。
数字基因表达形式分析的基础上,负二项分布
Bioconductor版本:2.8
估计variance-mean依赖在计数高通量测序数据分析和测试基于模型的微分表达式使用负二项分布
作者:西蒙•安德斯EMBL海德堡<桑德斯在fs.tum.de >
维修工:西蒙·安德斯<桑德斯在fs.tum.de >
从内部引用(R,回车引用(“DESeq”)):
安装
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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“DESeq”)
文档
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browseVignettes (“DESeq”)
| DESeq.pdf | ||
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ChIPseq,DifferentialExpression,HighThroughputSequencing,RNAseq,圣人,软件 |
| 版本 | 1.4.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.6 (r - 2.11)(6年) |
| 许可证 | GPL (> = 3) |
| 取决于 | Biobase,locfit |
| 进口 | genefilter,geneplotter、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www-huber.embl.de/users/anders/DESeq/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | ArrayExpressHTS,rnaSeqMap |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | DESeq_1.4.1.tar.gz |
| Windows二进制 | DESeq_1.4.1.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
| Mac OS X 10.9(小牛) | |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/deseq/tree/release - 2.8 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DESeq/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
