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这个包适用于Bioconductor的2.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见GSVA．

基因集变异分析

Bioconductor版本:2.8

基因集变异分析(GSVA)是一种非参数、无监督的方法，用于通过表达数据集的样本估计基因集富集的变异。GSVA执行坐标系的变化，将数据从样本矩阵的基因转换为样本矩阵的基因集，从而允许评估每个样本的通路富集。这种新的GSVA富集评分矩阵有助于以通路为中心应用标准分析方法，如功能富集、生存分析、聚类、cnv通路分析或跨组织通路分析。所有平台上的用户必须安装GNU科学库;有关详细信息，请参阅README文件，该文件可在该文件的源分发版中获得。

作者:Justin Guinney < Justin。基尼在sagebase.org>(with contributions from Robert Castelo and Sonja Haenzelmann

维护者:Justin Guinney < Justin。基尼在sagebase.org>

安装

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文档

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browseVignettes(“GSVA”)

PDF		GSVA.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学，微阵列，通路，软件
版本	1.0.1
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 2.13.0)，方法
进口	方法,Biobase，GSEABase
链接
建议	limma，qpgraph，图，Rgraphviz，RColorBrewer，genefilter，GSVAdata
SystemRequirements	GNU科学库>= 1.12
增强了	雪,多核
URL	http://www.sagebase.org
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	GSVA_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	GSVA_1.0.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/GSVA/tree/release-2.8
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GSVA/
软件包下载报告	下载数据