要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“GeneRegionScan”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GeneRegionScan

这个包适用于Bioconductor的2.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见GeneRegionScan

GeneRegionScan

Bioconductor版本:2.8

一个软件包,重点分析基因组的离散区域。这个包对于使用Affymetrix数据调查一个或几个基因非常有用,因为它将使用Affymetrix Power Tools应用程序提取探针级数据,并将这些数据包装到ProbeLevelSet中。ProbeLevelSet直接扩展了expressionSet,但是包含了关于每个探测序列和它所派生的探测集的附加信息。该包包括许多函数,用于绘制这些探针级数据作为沿着mrna链序列的位置函数。这可以用于可变剪接的分析,特别适合用于外显子阵列数据。

作者:Lasse Folkersen, Diego Diez

维护者:Lasse Folkersen < Lasse。Folkersen在ki.se>

引文(从R内,输入引用(“GeneRegionScan”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“GeneRegionScan”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GeneRegionScan”)

PDF GeneRegionScan.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImport微阵列OneChannel单核苷酸多态性软件可视化
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 方法,Biobase(> = 2.5.5),Biostrings
进口 Biobase(> = 2.5.5),affxparserRColorBrewerBiostrings
链接
建议 BSgenomeaffyAnnotationDbi
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 GeneRegionScan_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 GeneRegionScan_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GeneRegionScan/tree/release-2.8
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GeneRegionScan/
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弗雷德哈钦森癌症研究中心