要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“GeneRegionScan”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor的2.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见GeneRegionScan.
Bioconductor版本:2.8
一个软件包,重点分析基因组的离散区域。这个包对于使用Affymetrix数据调查一个或几个基因非常有用,因为它将使用Affymetrix Power Tools应用程序提取探针级数据,并将这些数据包装到ProbeLevelSet中。ProbeLevelSet直接扩展了expressionSet,但是包含了关于每个探测序列和它所派生的探测集的附加信息。该包包括许多函数,用于绘制这些探针级数据作为沿着mrna链序列的位置函数。这可以用于可变剪接的分析,特别适合用于外显子阵列数据。
作者:Lasse Folkersen, Diego Diez
维护者:Lasse Folkersen < Lasse。Folkersen在ki.se>
引文(从R内,输入引用(“GeneRegionScan”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“GeneRegionScan”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GeneRegionScan”)
GeneRegionScan.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | DataImport,微阵列,OneChannel,单核苷酸多态性,软件,可视化 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 2.4 (R-2.9)(7年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | 方法,Biobase(> = 2.5.5),Biostrings |
进口 | Biobase(> = 2.5.5),affxparser,RColorBrewer,Biostrings |
链接 | |
建议 | BSgenome,affy,AnnotationDbi |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | GeneRegionScan_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | GeneRegionScan_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GeneRegionScan/tree/release-2.8 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GeneRegionScan/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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