要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ Genomicranges”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

基因组机

该软件包适用于生物导体的2.8版;对于稳定的最新版本,请参阅基因组机

基因组间隔的表示和操纵

生物导体版本:2.8

在分析高通量测序数据(又称NGS数据)时,有效存储基因组注释和比对的能力正在发挥核心作用。该软件包定义了用于存储基因组间隔的通用容器以及更专业的容器,以存储针对参考基因组的比对。

作者:P。Aboyoun,H。Pages和M. Lawrence

维护者:Biocore团队C/O Bioc用户列表的BioConductor

引用(从r内,输入引用(“基因组”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ Genomicranges”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“基因组旋翼”)

PDF countgenomicoverlaps-decisiontree.pdf
PDF countgenomicoverlaps-genes.pdf
PDF countgenomicoverlaps.pdf
PDF 基因组神经引导。pdf
PDF genomicrangesusecases.pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 注解,,,,遗传学,,,,高通量序列,,,,测序,,,,软件
版本 1.4.8
在生物导体中 Bioc 2.6(R-2.11)(6年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 2.8.0),方法,iranges(> = 1.10.6)
进口 方法,iranges
链接 iranges
建议 运行,,,,BSGENOME,,,,GenomicFeatures,,,,rsamtools,,,,Eatonetalchipseq(> = 0.0.2),Leebamviews,,,,org.sc.sgd.db,,,,BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER2
系统要求
增强
URL
取决于我 BSGENOME,,,,Cheung2010,,,,chipseq,,,,Eatonetalchipseq,,,,GenomicFeatures,,,,ggtools,,,,图片,,,,rsamtools,,,,seqbias,,,,Shortread,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109
进口我 arrayexpresshts,,,,chipseq,,,,chipseqr,,,,GenomicFeatures,,,,Leebamviews,,,,图片,,,,RNASEQMAP,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,Shortread,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Genomicranges_1.4.8.tar.gz
Windows二进制 genomicranges_1.4.8.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/genomicranges/tree/release-2.8
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/genomicranges/
软件包下载报告 下载统计

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