要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ Genomicranges”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的2.8版;对于稳定的最新版本,请参阅基因组机。
生物导体版本:2.8
在分析高通量测序数据(又称NGS数据)时,有效存储基因组注释和比对的能力正在发挥核心作用。该软件包定义了用于存储基因组间隔的通用容器以及更专业的容器,以存储针对参考基因组的比对。
作者:P。Aboyoun,H。Pages和M. Lawrence
维护者:Biocore团队C/O Bioc用户列表
引用(从r内,输入引用(“基因组”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ Genomicranges”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“基因组旋翼”)
countgenomicoverlaps-decisiontree.pdf | ||
countgenomicoverlaps-genes.pdf | ||
countgenomicoverlaps.pdf | ||
基因组神经引导。pdf | ||
genomicrangesusecases.pdf | ||
参考手册 |
生物浏览 | 注解,,,,遗传学,,,,高通量序列,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.4.8 |
在生物导体中 | Bioc 2.6(R-2.11)(6年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 2.8.0),方法,iranges(> = 1.10.6) |
进口 | 方法,iranges |
链接 | iranges |
建议 | 运行,,,,BSGENOME,,,,GenomicFeatures,,,,rsamtools,,,,Eatonetalchipseq(> = 0.0.2),Leebamviews,,,,org.sc.sgd.db,,,,BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER2 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | BSGENOME,,,,Cheung2010,,,,chipseq,,,,Eatonetalchipseq,,,,GenomicFeatures,,,,ggtools,,,,图片,,,,rsamtools,,,,seqbias,,,,Shortread,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109 |
进口我 | arrayexpresshts,,,,chipseq,,,,chipseqr,,,,GenomicFeatures,,,,Leebamviews,,,,图片,,,,RNASEQMAP,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,Shortread,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109 |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | Genomicranges_1.4.8.tar.gz |
Windows二进制 | genomicranges_1.4.8.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/genomicranges/tree/release-2.8 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/genomicranges/ |
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