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该软件包适用于Bioconductor的2.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见HTSanalyzeR。

高通量筛选的基因集过度表达、富集和网络分析

Bioconductor版本:2.8

这个包提供类和方法的基因集过度代表，富集和网络分析的高通量屏幕。在超几何检验的基础上进行了超表征分析。富集分析基于GSEA算法(Subramanian et al.)。PNAS 2005)。网络分析基于BioNet包中的算法识别丰富的子网(Beisser et al.， Bioinformatics 2010)。cellHTS2对象还专门设计了一个管道来执行高通量RNA干扰筛选的综合网络分析。用户可以基于此包为自己的数据集构建自己的分析管道。

作者:王欣<欣。Wang在cancer.org.uk>，Camille Terfve , John C. Rose , Florian Markowetz

维护者:Xin Wang

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

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browseVignettes(“HTSanalyzeR”)

PDF		Figure.pdf
PDF		HTSanalyzeR-Vignette.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学，CellBasedAssays，MultipleComparisons，软件
版本	2.5.1
在Bioconductor中	BioC 2.7 (R-2.12)(5.5岁)
许可证	艺术- 2.0
取决于	igraph，GSEABase，生命网络，cellHTS2，RankProd、方法
进口	图，igraph，GSEABase，生命网络，cellHTS2，AnnotationDbi，biomaRt
链接
建议	KEGG.db，GO.db，org.Dm.eg.db，GOstats，org.Ce.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Rn.eg.db，org.Hs.eg.db，雪
SystemRequirements
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源	HTSanalyzeR_2.5.1.tar.gz
Windows二进制	HTSanalyzeR_2.5.1.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/HTSanalyzeR/tree/release-2.8
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/HTSanalyzeR/
软件包下载报告	下载数据