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这个包适用于Bioconductor的2.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见KEGGgraph．

KEGGgraph: R和Bioconductor中KEGG通路的图形方法

Bioconductor版本:2.8

KEGGGraph是KEGG路径和图形对象之间的接口，也是用于分析、解析和可视化这些图形的工具集合。它将定期更新的KGML (KEGG XML)文件解析为维护所有基本路径属性的图模型。该软件包提供了包括解析、图形操作、可视化等功能。

作者:Jitao David Zhang, Stefan Wiemann

维护者:Jitao David Zhang

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“KEGGgraph”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“KEGGgraph”)

PDF		KEGGgraph.pdf
PDF		KEGGgraphApp.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	GraphsAndNetworks，通路，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	方法,XML(2.3 > = 0),图，Rgraphviz(> = 1.22.0)
进口	方法,XML，图
链接
建议	RBGL，KEGG.db，org.Hs.eg.db，hgu133plus2.db，SPIA
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.dkfz.de/en/mga/index.html
全靠我
进口我	DEGraph，NCIgraph
建议我	DEGraph，SPIA
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	KEGGgraph_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	KEGGgraph_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/KEGGgraph/tree/release-2.8
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/KEGGgraph/
软件包下载报告	下载数据