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此包适用于Bioconductor的2.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见MEDIPS．

MeDIP-Seq数据分析

Bioconductor版本:2.8

MEDIPS用于分析甲基化DNA免疫沉淀(MeDIP)实验和测序(MeDIP- seq)得到的数据。然而，像质量控制这样的功能可以应用于其他类型的测序数据(例如ChIP-Seq)。MEDIPS在MeDIP-Seq数据分析的背景下解决了几个方面。

作者:卢卡斯·查韦斯，乔恩·迪特里希

维护者:Lukas Chavez < Chavez at molgen.mpg.de>

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("MEDIPS")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“MEDIPS”)

PDF		MEDIPS.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPseq，CpGIsland，DNAMethylation，DifferentialExpression，HighThroughputSequencing，预处理，质量控制，测序，软件，可视化
版本	1.2.0
在Bioconductor公司	BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 2.12.0)，BSgenome
进口	Biostrings，BSgenome、图形、gtools，IRanges，方法，统计，效用
链接
建议	BSgenome，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	MEDIPS_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MEDIPS_1.2.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(小牛队)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/MEDIPS/tree/release-2.8
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MEDIPS/
软件包下载报告	下载数据