要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("R453Plus1Toolbox")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

R453Plus1Toolbox

此包适用于Bioconductor的2.8版本;有关稳定的最新发布版本,请参见R453Plus1Toolbox

用于从罗氏基因组测序系统导入和分析数据的软件包。

Bioconductor版本:2.8

R453Plus1工具箱包含了罗氏454测序平台生成的数据分析的有用功能。它增加了质量保证功能,以及对检测到的变体的注释和可视化功能,补充了罗氏产品附带的软件工具。此外,还提供了用于检测结构变体的管道。

作者:Hans-Ulrich Klein, Christoph Bartenhagen, Christian Ruckert

维护者:Hans-Ulrich Klein

引用(从R中,输入引用(“R453Plus1Toolbox”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("R453Plus1Toolbox")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“R453Plus1Toolbox”)

PDF vignette.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImportDataRepresentationHighThroughputSequencing基础设施质量控制ReportWriting软件可视化
版本 1.2.2
Bioconductor自 BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年)
许可证 LGPL-3
取决于 R (> = 2.12.0),BiobaseBiostringsBSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2
进口 BiobasebiomaRtBiostringsBSgenomeIRanges(> = 1.10.2)、方法R2HTMLRsamtoolsrtracklayerShortRead
链接
建议 rtracklayerShortReadRsamtoolsBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 R453Plus1Toolbox_1.2.2.tar.gz
Windows二进制 R453Plus1Toolbox_1.2.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(小牛队)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/R453Plus1Toolbox/tree/release-2.8
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/R453Plus1Toolbox/
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弗雷德·哈钦森癌症研究中心