要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("R453Plus1Toolbox")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的2.8版本;有关稳定的最新发布版本,请参见R453Plus1Toolbox.
Bioconductor版本:2.8
R453Plus1工具箱包含了罗氏454测序平台生成的数据分析的有用功能。它增加了质量保证功能,以及对检测到的变体的注释和可视化功能,补充了罗氏产品附带的软件工具。此外,还提供了用于检测结构变体的管道。
作者:Hans-Ulrich Klein, Christoph Bartenhagen, Christian Ruckert
维护者:Hans-Ulrich Klein
引用(从R中,输入引用(“R453Plus1Toolbox”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("R453Plus1Toolbox")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“R453Plus1Toolbox”)
vignette.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | DataImport,DataRepresentation,HighThroughputSequencing,基础设施,质量控制,ReportWriting,软件,可视化 |
版本 | 1.2.2 |
Bioconductor自 | BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | R (> = 2.12.0),Biobase,Biostrings,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2 |
进口 | Biobase,biomaRt,Biostrings,BSgenome,IRanges(> = 1.10.2)、方法R2HTML,Rsamtools,rtracklayer,ShortRead |
链接 | |
建议 | rtracklayer,ShortRead,Rsamtools,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | R453Plus1Toolbox_1.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | R453Plus1Toolbox_1.2.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Mac OS X 10.9(小牛队) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/R453Plus1Toolbox/tree/release-2.8 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/R453Plus1Toolbox/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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