##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("Rsamtools")

此包适用于Bioconductor的2.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见Rsamtools．

导入对齐的BAM文件格式序列到R / Bioconductor中

Bioconductor版本:2.8

这个包提供了一个到'samtools'实用程序(参见' license ')的接口，用于操作SAM(序列对齐/映射)格式文件。目前可用的工具包括灵活的文件输入。

作者:马丁·摩根，Herv\'e Pag\ ' es

维护者:Biocore Team c/o BioC用户列表

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("Rsamtools")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“Rsamtools”)

PDF		Rsamtools-Overview.pdf
PDF		Rsamtools-UsingCLibraries.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，HighThroughputSequencing，测序，软件
版本	3
Bioconductor自	BioC 2.6 (R-2.11)(6年)
许可证	artist -2.0 +文件许可证
取决于	方法,IRanges(> = 1.9.4),GenomicRanges(> = 0.1.0),Biostrings(> = 2.15.0)
进口	方法,跑龙套,IRanges，GenomicRanges，Biostrings
链接	Biostrings，IRanges
建议	ShortRead，GenomicFeatures，RUnit，KEGG.db
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/packages/release/bioc/html/Rsamtools.html
取决于我	ArrayExpressHTS，girafe，ind1KG，leeBamViews，qrqc，rnaSeqMap，ShortRead
进口我	ArrayExpressHTS，R453Plus1Toolbox，ShortRead
建议我	GenomicRanges，R453Plus1Toolbox
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	Rsamtools_1.4.3.tar.gz
Windows二进制	Rsamtools_1.4.3.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(小牛队)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/Rsamtools/tree/release-2.8
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Rsamtools/
包下载报告	下载数据