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这个包适用于Bioconductor的2.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见ShortRead．

用于高通量短读测序数据的类和方法。

Bioconductor版本:2.8

用于表示高通量、短读测序数据的基类、函数和方法。

作者:马丁·摩根，迈克尔·劳伦斯，西蒙·安德斯

维护者:Biocore Team c/o BioC用户列表

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“ShortRead”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ShortRead”)

PDF		Overview.pdf
PDF		ShortRead_and_HilbertVis.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，HighThroughputSequencing，质量控制，测序，软件
版本	1.10.4
在Bioconductor	BioC 2.3 (R-2.8)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,IRanges(> = 1.10.2),GenomicRanges，Biostrings(> = 2.19.0),晶格，Rsamtools
进口	IRanges，GenomicRanges，Biostrings，Biobase，hwriter，Rsamtools
链接	IRanges，Biostrings
建议	biomaRt，RUnit
SystemRequirements
增强了	Rmpi,多核
URL
全靠我	chipseq，ChIPseqR，DEGseq，EatonEtAlChIPseq，girafe，OTUbase，Rolexa，segmentSeq
进口我	ArrayExpressHTS，chipseq，ChIPseqR，ChIPsim，OTUbase，R453Plus1Toolbox，Rolexa
建议我	CSAR，Genominator，图片，R453Plus1Toolbox，Rsamtools，yeastRNASeq
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	ShortRead_1.10.4.tar.gz
Windows二进制	ShortRead_1.10.4.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/ShortRead/tree/release-2.8
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ShortRead/
软件包下载报告	下载数据