要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ crlmm”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

crlmm

该软件包适用于生物导体的2.8版;对于稳定的最新版本,请参阅crlmm

Affymetrix SNP 5.0和6.0和Illumina阵列的基因型调用(CRLMM)和复制号分析工具。

生物导体版本:2.8

更快地实现了针对SNP 5.0和6.0阵列的CRLMM,以及特定于5.0、6.0和Illumina平台的复制号工具

作者:Benilton的Carvalho ,Robert Scharpf ,Matt Ritchie ,Ingo Ruczinski

维护者:贝尼尔顿(Benilton)的carvalho ,Robert Scharpf ,Matt Ritchie

引用(从r内,输入引用(“ crlmm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ crlmm”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ crlmm”)

PDF affymetrixpreprocesscn.pdf
PDF CAPYNUMBER.PDF
PDF crlmmdownstream.pdf
PDF crlmmillumina.pdf
PDF Illumina_copynumber.pdf
PDF IlluminapreProcesscn.pdf
PDF 基础架构.pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 生物信息学,,,,库务,,,,微阵列,,,,预处理,,,,SNP,,,,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 2.4(R-2.9)(7年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.13.0),方法,生物酶(> = 2.11.9),寡群(> = 1.13.22)
进口 affyio(> = 1.19.2),椭圆,,,,ff(> = 2.2-1),GeneFilter(> = 1.33.0),mvtnorm,,,,预处理(> = 1.13.4),花键,统计,Snpchip,UTILS
链接
建议 hapmapsnp6,,,,Genomewidenp6crlmm(> = 1.0.4),Snpmatrix,,,,椭圆,,,,运行
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 hapmap370k
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 crlmm_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 crlmm_1.10.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/crlmm/tree/release-2.8
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/crlmm/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

弗雷德·哈钦森癌症研究中心