要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“hopach”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

hopach

这个包适用于Bioconductor的2.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见hopach

分层有序分区和折叠混合(HOPACH)

Bioconductor版本:2.8

HOPACH聚类算法通过递归地划分数据集来构建一个簇的层次树,同时在每个级别上对簇进行排序和可能的折叠。该算法使用均值/中值分割轮廓(MSS)准则来识别具有最大同质聚类的树的级别。它还向下运行树以生成元素的最终有序列表。非参数引导允许人们估计每个元素属于每个聚类(模糊聚类)的概率。

作者:Katherine S. Pollard, Mark J. van der Laan < Laan at stat.berkeley.edu>和Greg Wall

维护者:Katherine S. Pollard < Katherine。Pollard在gladstone.ucsf.edu>

引文(从R内,输入引用(“hopach”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“hopach”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“hopach”)

PDF bootplot.pdf
PDF dplot.pdf
PDF hopach.pdf
PDF hopachManuscript.pdf
PDF MSS.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类软件
版本 2.12.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.11.0),集群Biobase、方法
进口 Biobase集群,图形,grDevices,方法,统计,utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://www.stat.berkeley.edu/~laan/http://docpollard.com/
全靠我
进口我 phenoTest
建议我 BiocCaseStudies
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 hopach_2.12.0.tar.gz
Windows二进制 hopach_2.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/hopach/tree/release-2.8
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/hopach/
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