要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“nem”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

nem

这个包适用于Bioconductor的2.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见nem

嵌套效应模型来重建表型层次结构

Bioconductor版本:2.8

包'nem'允许从扰动效应的嵌套结构中重建路径的特征。它将(1.)一组被扰动的通路成分作为输入,(2.)这些扰动的高维表型读数(例如基因表达或形态谱)。输出是代表表型层次结构的有向图。

作者:Holger Froehlich, Florian Markowetz, Achim Tresch, Christian Bender, Matthias Maneck, Claudio Lottaz, Tim Beissbarth

维护者:Holger Froehlich

引文(从R内,输入引用(nem)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“nem”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes (nem)

PDF markowetz -论文- 2006. - pdf
PDF nem.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学GraphsAndNetworks微阵列通路软件
版本 2.16.1
在Bioconductor BioC 1.9 (R-2.4)(9.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.0),e1071(> = 1.5),(> = 1.24),Rgraphviz(> = 1.22),plotrixlimma,时间(>= 1.0),集群(> = 1.11),statmod
进口 引导e1071,图形,grDevices,方法,RBGL(> = 1.8.1),RColorBrewerRgraphviz,统计,效用
链接
建议 Biobase(> = 1.10)
SystemRequirements
增强了 doMC
URL //www.andersvercelli.com
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 nem_2.16.1.tar.gz
Windows二进制 nem_2.16.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/nem/tree/release-2.8
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/nem/
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请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

弗雷德哈钦森癌症研究中心