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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ oligo”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

奥利戈

该软件包适用于生物导体的2.8版;对于稳定的最新版本,请参阅奥利戈

寡核苷酸阵列的预处理工具。

生物导体版本:2.8

用于分析探针级别的寡核苷酸阵列(表达/SNP/瓷砖/外显子)的包装。它当前支持Affymetrix(CEL文件)和Nimblegen数组(XYS文件)。

作者:Benilton carvalho ,Rafael A. Irizarry,由Ben Bolstad,Vince Carey,Robert Carey,Robert Gentleman,Wolfggang Huber捐款

维护者:benilton carvalho

引用(从r内,输入引用(“ Oligo”)):

安装

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Oligo”)

PDF v1overview.pdf
PDF v2nexpression.pdf
PDF v3affysnpgenotype.pdf
PDF v4scrementiment.pdf
PDF v5exongene.pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 生物信息学,,,,芯片,,,,库务,,,,CPGISLAND,,,,DNAMETHYLATY,,,,DataImport,,,,差异性,,,,exonarray,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,SNP,,,,软件,,,,转录,,,,两通道
版本 1.16.2
在生物导体中 Bioc 2.0(R-2.5)(9年)
执照 LGPL(> = 2)
要看 r(> = 2.13.0),寡群(> = 1.13.9),预处理(> = 1.13.5)
进口 affyio(> = 1.19.4),affxparser(> = 1.23.1),生物酶(> = 2.11.8),生物弦,,,,DBI(> = 0.2-5),ff,图形,方法,细条,统计,UTILS
链接 预处理
建议 hapmap100kxba,,,,pd.mapping50k.xba240,,,,pd.huex.1.0.st.v2,,,,pd.hg18.60mer.expr,,,,maqcexpression4plex,,,,GeneFilter,,,,林玛,,,,rcolorbrewer,,,,寡头
系统要求
增强 ff,,,,
URL
取决于我 斜体,,,,寡头,,,,pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1,,,,PD.2006.07.18.hg18.refseq.promoter,,,,PD.2006.07.18.mm8.refseq.promoter,,,,PD.2006.10.31.RN34.REFSEQ.PROMOTER,,,,pd.ag,,,,pd.barley1,,,,pd.bovine,,,,pd.bsubtilis,,,,pd,,,,pd.canine.2,,,,pd.celegans,,,,pd.charm.hg18.example,,,,pd.Chicken,,,,pd.Citrus,,,,PD.Cotton,,,,pd.cytegenetics.array,,,,pd.Drosgenome1,,,,PD.Drosophila.2,,,,PD.E.COLI.2,,,,pd.ecoli,,,,pd.ecoli.asv2,,,,pd.feinberg.hg18.me.hx1,,,,pd.feinberg.mm8.me.hx1,,,,pd.Genomewidenp.5,,,,pd.Genomewidenp.6,,,,PD.HC.G110,,,,pd.hg.Focus,,,,pd.hg.u133.plus.2,,,,pd.hg.u133a,,,,pd.hg.u133a.2,,,,pd.hg.u133a.tag,,,,pd.hg.u133b,,,,pd.hg.u219,,,,pd.hg.u95a,,,,pd.hg.u95av2,,,,pd.hg.u95b,,,,pd.hg.u95c,,,,pd.hg.u95d,,,,pd.hg.u95e,,,,pd.ht.hg.u133.plus.pm,,,,pd.ht.hg.u133a,,,,pd.ht.mg.430a,,,,pd.hu6800,,,,pd.huex.1.0.st.v2,,,,pd.hugene.1.0.st.v1,,,,pd.hugene.1.1.st.v1,,,,pd.maize,,,,pd.mapping250k.nsp,,,,pd.mapping250k.Sty,,,,pd.mapping50k.hind240,,,,pd.mapping50k.xba240,,,,pd.Medicago,,,,pd.mg.u74a,,,,pd.mg.u74av2,,,,pd.mg.u74b,,,,pd.mg.u74bv2,,,,pd.mg.u74c,,,,pd.mg.u74cv2,,,,pd.mirna.1.0,,,,pd.moe430a,,,,pd.moe430b,,,,pd.moex.1.0.st.v1,,,,pd.mogene.1.0.st.v1,,,,pd.mogene.1.1.st.v1,,,,PD.Mouse430.2,,,,PD.Mouse430a.2,,,,pd.mu11ksuba,,,,pd.mu11ksubb,,,,pd.pae.g1a,,,,pd.plasmodium.anopheles,,,,PD.Poplar,,,,pd.porcine,,,,PD.RAE230A,,,,PD.RAE230b,,,,pd.raex.1.0.st.v1,,,,pd.ragene.1.0.st.v1,,,,pd.ragene.1.1.st.v1,,,,PD.RAT230.2,,,,pd.rg.u34a,,,,pd.rg.u34b,,,,pd.rg.u34c,,,,pd.RESUS,,,,pd.rice,,,,PD.RN.U34,,,,pd.s.aureus,,,,pd.soybean,,,,pd.sugar.cane,,,,pd.tomato,,,,pd.u133.x3p,,,,pd.Vinifera,,,,pd.wheat,,,,pd.x.laevis.2,,,,pd.x.tropicalis,,,,pd.xenopus.laevis,,,,pd.yeast.2,,,,pd.yg.s98,,,,pd.zebrafish,,,,pdinfobuilder
进口我 魅力,,,,CN.Farms,,,,FRMA,,,,斜体,,,,makePlatFormDesign
建议我 Frmatools,,,,hapmap100khind,,,,hapmap100kxba,,,,hapmap500knsp,,,,hapmap500ksty,,,,hapmapsnp5,,,,hapmapsnp6,,,,maqcexpression4plex
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 oligo_1.16.2.tar.gz
Windows二进制 oligo_1.16.2.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/oligo/tree/release-2.8
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/oligo/
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